Caracterização fenotípica e genotípica de animais da raça Hereford criados na região sul do estado do Rio Grande do Sul durante surtos de Ceratoconjuntivite Infecciosa Bovina
Date
2018-02-23Metadata
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Esta dissertação foi dividida em quatro capítulos, tendo como principais objetivos: i)
realizar a identificação bacteriológica dos agentes envolvidos na Ceratoconjuntivite
Infecciosa Bovina (CIB), por meio de diferentes técnicas: análise morfo-tintorial e
bioquímica, Espectrometria de massas com fonte de ionização e dessorção a laser
assistida por matriz e analisador de massas do tipo tempo-de-voo (MALDI-TOF),
Reação em cadeia da polimerase (PCR) e sequenciamento. ii) avaliar a diversidade
genética de bactérias das espécies Moraxella bovis e Moraxella bovoculi isoladas de
surtos de CIB entre 2015 e 2017, utilizando as técnicas de ERIC-PCR
(enterobacterial repetitive intergenic consensus), RAPD-PCR (random amplification
of polymorphic DNA) e uma variação do RAPD-PCR com os primers JWP1 e
JWOPA07. iii) estimar os parâmetros e valores genéticos por meio da avaliação
tradicional pelo modelo animal para a incidência de CIB. iv) realizar estudo de
associação ampla do genoma (GWAS) para identificação de regiões genômicas e
SNPs mais representativos para susceptibilidade à CIB. Logo no início do surto de
CIB amostras de secreções oculares e nasais foram coletadas de bovinos da raça
Hereford para possibilitar a identificação do agente bacteriológico causador da
enfermidade, com isso confirmar o surto de CIB. Os animais eram provenientes de
cinco fazendas, criados no sul do estado do Rio Grande do Sul. Foram realizadas
quatro avaliações, com intervalo médio de 30 dias. O monitoramento teve como
finalidade a realização da fenotipagem com relação à susceptibilidade à doença, por
meio do acompanhamento da evolução dos surtos de CIB nas propriedades, a partir
da atribuição de escores de lesão ocular. Foram atribuídos escores para as lesões
de CIB, para cada um dos olhos, em uma escala de zero a quatro, na qual zero
indicava o olho normal e quatro o estágio mais avançado da doença, implicando em
perda ocular. As melhores concordâncias obtidas entre os métodos de identificação
bacteriológica estudada foram à identificação por MALDI-TOF e a identificação
molecular (PCR), confirmadas por sequenciamento, a partir do DNA extraído das
colônias de Moraxella spp. Ademais, foi confirmada a existência de variabilidade
genética entre as cepas de Moraxella bovis e Moraxella bovoculi isoladas de bovinos
da raça Hereford, acometidos por CIB, pertencentes a cinco diferentes municípios
situados no estado do Rio Grande do Sul. Os coeficientes de herdabilidade preditos
foram de 0,14, 0,096 e 0,099 para as categorias (c_2, c_3 e c_9) para incidência a
CIB. Os estudos de GWAS apontaram janelas genômicas significativas nos
cromossomos 3, 11, 14, 18, 26 e 27 associados à CIB. As análises de
enriquecimento funcional revelaram oito termos significativos (p<0,05) associados
com a susceptibilidade a CIB: Babesia, Plasmodium vivax, Babesiosis, Bood
bactericidal activity, Retinal cone photorecptor cells, Animal nutritional physiological
phenomena, COS cells e 5 Flanking region. Os termos MeSH, apontam para
importantes processos biológicos que estão relacionados com a expressão
fenotípica das lesões ocorridas pela CIB. Concluindo, as análises fenotípicas e
genômicas realizada ao longo deste estudo podem auxiliar na concepção de
estratégias de prevenção e tratamento contra o CIB, podendo colaborar com
estratégias de seleção por animais resistentes a CIB.