Classificação de dados de metagenoma para detecção de vírus de interesse em saúde humana: monitoramento ambiental de SARS-Cov-2 como um caso de estudo

Abstract

O advento do sequenciamento de DNA de nova geração (next generation sequencing, NGS) permitiu um aumento expressivo na velocidade para obtenção de grandes volumes de dados genômicos, bem como de outras áreas das ciências ômicas, como transcriptômica e metagenômica (Liu et al., 2012). A metagenômica, também chamada “genômica ambiental”, consiste na análise em larga de escala de dados derivados de sequenciamento de DNA de amostras complexas (metagenoma), que muitas vezes apresentam uma grande variedade de microorganismo. A análise do metagenoma pode ser realizada a partir da amplificação de marcadores taxonômicos seguida do sequenciamento ou a partir de técnicas de sequenciamento shotgun (whole metagenome shotgun), que permite também a caracterização funcional de genes (Bragg & Tyson, 2014).