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Tipo: masterThesis
Título: Análise in silico e de expressão da família gênica Ethylene Response Factors (ERF) no gênero Malus.
Título(s) alternativo(s): In silico and expression analysis of the Ethylene Response Factors (ERF) gene family in the genus Malus.
Autor(es): Cero, Joceani Dal
metadata.dc.contributor.advisor-co1: Rombaldi, César Valmor
Resumo: Moléculas que participam dos processos regulatórios, como os fatores de transcrição, têm recebido atenção especial, pois uma das principais ações dos estímulos hormonais é a modulação da expressão gênica. Como a taxa de transcrição de um gene é o maior determinante da sua expressão, os mecanismos moleculares pelos quais a transcrição gênica é regulada têm se tornado um dos tópicos principais de estudos em genética molecular envolvendo o hormônio etileno. O objetivo deste trabalho foi realizar análises de bioinformática para a família ERF (Ethylene Response Factors), integrar bases de dados existentes na internet no modelo Arabidopsis, bem como análise filogenética que permitam avaliar os papéis dos diferentes membros da família. Este levantamento preliminar das seqüências ERF em Malus forneceu informação básica para estudos posteriores mais aprofundados, com relação aos mecanismos moleculares da família nesta importante cultura perene. A análise da expressão de MdERF1 e MdERF2 em frutos de maçã indica que outros fatores além do etileno estão envolvidos na regulação da transcrição dos ERF em Malus. O segundo capítulo refere-se à resposta dos ERF frente ao ataque de patógenos. Para isso, foram infectadas plantas de macieira provenientes de cutivo in vitro com o fungo Venturia inaequalis (sarna da maçã). As evidências desses estudos sugerem o envolvimento do gene MdERF1 no processo de patogênese, enquanto que o gene MdERF2 parece não estar envolvido no processo.
Abstract: Regulatory molecules, such as transcription factors, have been thoroughly investigated, especially in hormone-mediated responses that involve gene expression modulation. Frequently, the main determinant of gene expression is its transcriptional rate. Thus, molecular mechanisms underlying transcription regulation have become an important topic in genetic studies of ethylene signaling. The present work aimed to investigate the ERF (Ethylene Response Factor) family employing bioinformatic tools, integrating publicly available datasets from the model species Arabidopsis thaliana and phylogenetic analyses to help elucidating the biological roles of the family in apple. The preliminary survey of the ERF sequences in Malus has provided basic information to be incorporated in further studies of the functional role of ERFs in this perennial species. Expression analyses of MdERF1 and MdERF in apple fruits suggest that other factors, besides ethylene, are involved in their transcriptional regulation in Malus. The second chapter reports the investigation of the transcriptional profiling of those ERF genes in response to pathogen attack, using a biological assay of in vitro propagated plants inoculated with the fungus Venturia inaequalis (apple scab disease). The study has provided evidences of the involvement of MdERF1 in eliciting the plant response; whereas, MdERF2 does not appear to be participate in the pathogenesis.
Palavras-chave: Malus
Análise in silico
Erf
Etileno
Análise de expressão
Maçã
Venturia inaequalis
Malus
In silico analysis
Ethylene
Expression analysis
Apple
Venturia inaequalis
CNPq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::CIENCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS::TECNOLOGIA DE ALIMENTOS
Idioma: por
País: BR
Editor: Universidade Federal de Pelotas
Sigla da Instituição: UFPel
metadata.dc.publisher.department: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
metadata.dc.publisher.program: Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia Agroindustrial
Citação: CERO, Joceani Dal. In silico and expression analysis of the ETHYLENE RESPONSE FACTORS (ERF) gene family in the genus Malus.. 2010. 126 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2010.
Tipo de Acesso: OpenAccess
URI: http://hdl.handle.net/123456789/1340
Data do documento: 26-Fev-2010
Aparece nas coleções:Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia Agroindustrial: Dissertações e Teses

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